报告题目：空间组学Stereoseq介绍及细胞注释

报 告 人：刘林研究员

报告时间：2024年4月28日(周日)上午：9:00-11:00

报告地点：综合实验楼4楼会议室

报告摘要：单细胞转录组技术能为正常、发育和病变细胞、组织、器官、疾病提供基因表达图谱，促进新型细胞类别的鉴定，改进我们对正常和疾病相关的生理过程的理解，并促进新治疗方法的开发。那么，时空组学技术突破，则可帮助我们了解细胞命运复杂调控过程。时空组学全面应用于器官结构、生命发育、生命演化、人类疾病等重大问题研究，将推动生命科学和医学领域的发展。Stereo-seq技术将推动生命科学研究进入到时空时代。但是，新的生物技术对于新的生物信息算法与工具提出了新的挑战，基于此，课题组提出了针对空间转录组的细胞注释算法与工具spatial-ID。

报告人简介：刘林，深圳华大生命科学研究院，生物智能技术研究所，生物信息研究员，深圳市高层次人才(海外)，盐田区梧桐人才。主导开发多个生物信息相关原创分析方P法，包括整合代谢网络和调控网络的建模框架r-deFBA,空间组学细胞类型注释方法Spatial-ID及多数据整合算法spatialign等。主要研究工作发表在Nature Communications (IF=16.6), Journal of Integrative Plant Biology (IF=11.4), GigaScience (IF=9.2)等国际期刊上，授权国际专利4项。研究方向为生物信息高级分析算法和工具研发，包括DNA序列AI大模型、单细胞/空间多组学、多模态数据挖掘及整合算法和工具研究。

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